维普本科论文查重与知网的区别主要体现在查重算法和文献资源上。维普本科论文查重系统采用先进的查重算法，能够更精准地检测论文中的重复内容，同时覆盖了丰富的文献资源，包括期刊、会议论文等，能够更全面地进行查重比对。而知网虽然也有查重功能，但其算法相对较为简单，对于一些变换词语、改变句子结构的抄袭形式检测能力较弱，且文献资源相对较少，覆盖范围不如维普广泛。

此外，维普本科论文查重系统还提供了论文写作辅助功能，包括文献检索、参考文献管理等，有利于学生更好地进行学术研究和论文写作。而知网相对更偏重于文献检索和引用分析，对于论文查重的支持相对较为简单，不具备辅助写作的功能。因此，根据实际需求，选择维普本科论文查重系统或知网进行查重，需考虑到自身的需求和论文写作的具体情况。